Dès 1883, le Directeur Principal des Frères à l’époque, le Frère Hermias, avait décidé de fonder l’Institution Saint-Louis de Gonzague. Il lui choisit comme premier Supérieur le Frère Odile-Joseph qui dirigeait l’Ecole des Frères aux Cayes.
Celui-ci resta dix ans à la direction de Saint-Louis, de 1890 à 1900.
Se sont succédés par la suite à la tête de l’Institution :
Frere Eudoxie-Marie 1900-1903
Elie-Marie 1903-1910
Paul-de la Croix 1910-1917
Hippolyte-Victor 1917-1923
Ferdinand Pierre 1923-1930
Gabriel-Edouard 1930-1933
Yves-Joseph 1933-1939
Romuald-Pierre 1939-1946
Dominique 1946-1953
Constant 1953-1956
Joachim-Joseph 1956-1962
André de Candie 1962-1968
Philippe-Marie 1968-1971
Hubert 1971-1973
Ce dernier, à l’ouverture de Saint-Louis Delmas, en a été nommé le premier Supérieur.